La structure organisationnelle du Centre de santé et de services sociaux de Bécancour–Nicolet-Yamaska (CSSSBNY) s'appuie sur neuf directions et un adjoint à la Direction générale, à savoir :
- La Direction de la santé physique
Mme Francine Courchesne, directrice
- La Direction des services à la communauté et des services multidisciplinaires
Mme Claudette Boutin, directrice
- La Direction des services aux personnes en perte d'autonomie
M. Jean-Pierre Fraser, directeur
- La Direction de l'hébergement institutionnel
Mme Évelyne Pagé, directrice
- La Direction des soins infirmiers
Mme Marie-Claude Brunelle, directrice
- La Direction des services professionnels
Docteur Dominique Tardif, directeur
- La Direction des ressources humaines
M. Denis Bergeron, directeur
- La Direction des services techniques et informationnels
M. Sylvain Noury, directeur
- La Direction des services financiers
La coordination de cette direction est assurée par Mme Guylaine Provencher, coordonnatrice des services financiers, et relève directement de Mme Danielle Gamelin, directrice générale.
- L'adjoint à la Direction générale
M. Paul Baril